El IAFE sigue manteniendo hoy día los principales objetivos del Convenio de Cooperación de 1971, con excepción del último, que en 1991 pasa a constitutir el propósito fundamental de la Comisión Nacional de Asuntos Espaciales (CONAE), institución existente hasta nuestros días:

> Desarrollar investigaciones científicas en el campo de la Astronomía y la Física del Espacio, centrado en problemas astrofísicos no cubiertos por otras instituciones nacionales.

> Brindar consejo y ayuda a otros institutos interesados en los mismos campos de investigación.

> Divulgar información acerca de los temas que investiga, a través de los medios y procedimientos apropiados.

> Contribuir a la formación de investigadores en estos campos.

> Mantener relaciones científicas con instituciones similares nacionales, extranjeras e internacionales

> Llevar a cabo desarrollos tecnológicos, especialmente en el área de la electrónica, transferibles a otros sectores del sistema científico-tecnológico del país.